Recombinação aprimorada entre variantes de ômicron demonstrada contribui para a fuga imune viral, constata estudo

Em janeiro de 2022, na época em que a variante ômicron do SARS-CoV-2 começou a se espalhar rapidamente, uma equipe de pesquisadores do Indian Institute of Science (IISc) liderada por Shashank Tripathi, professor assistente do Departamento de Microbiologia e Biologia Celular, e Centro de Pesquisa de Doenças Infecciosas, notaram que houve um aumento incomumente alto no número de cepas recombinantes da variante omicron.

A equipe analisou sequências genômicas de todos os cepas virais que apareceu entre novembro de 2019 e julho de 2022 em vários bancos de dados em todo o mundo. Em um estudo publicado no Jornal de Virologia Médicaeles identificaram várias novas mutações que se acumularam por recombinação em alta taxa e afetaram proteínas viraisespecialmente diferentes partes (domínios) da proteína viral spike.

Esses domínios, como o Receptor Binding Domain (RBD) e o N Terminal Domain (NTD), são conhecidos por estarem envolvidos na ligação vírus-hospedeiro e também foram relatados como locais de ataque pelo sistema imunológico do hospedeiro. A equipe mostrou que, com a ajuda dessas mutações, várias dessas cepas recombinantes e mutantes de ômicron conseguiram escapar das defesas do hospedeiro e se ligar mais fortemente ao célula hospedeira.

Suas observações aumentam a evidência crescente sobre a eficiência das novas cepas do vírus em escapar do ataque imunológico e causar infecções.

Sabe-se que vírus como o SARS-CoV-2 mudam constantemente, tornando difícil para o nosso sistema imunológico identificá-los e destruí-los. Esta é uma grande preocupação ao gerar vacinas. O material genético no SARS-CoV-2 é um longo RNA de cadeia simples. Além disso, sabe-se que a proteína necessária para fazer cópias desse RNA – RNA polimerase – é propensa a erros nesse vírus.

Os vírus podem evoluir por um de dois mecanismos: mutação ou recombinação, explica Tripathi. “Esta é uma estratégia para aumentar sua diversidade genética.” A polimerase não apenas permite que as mutações se acumulem, mas também causa a recombinação entre diferentes cepas do vírus. Isso é possível quando há coinfecção – quando uma célula hospedeira é infectada por mais de uma cepa do vírus.

“Ao copiar o RNA viral, a polimerase pode pular de um modelo de RNA para outro que esteja próximo”, diz Tripathi. Se a sequência próxima for de outra linhagem, a nova cópia será uma recombinante ou híbrida das duas linhagens parentais. Tripathi diz que atualmente existem mais de 35 recombinantes do SARS-CoV-2. Por exemplo, uma das variantes mais eficientes, a XBB, que surgiu em 2022, nasceu da recombinação entre duas outras versões do omicron, explica.

Existem duas razões possíveis para o aumento desses eventos de recombinação, de acordo com o estudo. Primeiro, o número de infecções e coinfecções foi alto durante a onda de 2022 omicron. Em segundo lugar, a equipe notou que uma mutação específica apareceu em um gene viral para uma exonuclease, uma proteína que pode clivar o RNA e acredita-se estar envolvida na recombinação. Tripathi explica: “Nossas descobertas mostram que o vírus não está esfriando, mas na verdade está aquecendo no que diz respeito às mutações”.

Porque aprimorado recombinação podem aumentar as chances de surgimento de novas cepas, rastrear essas recombinações por meio do sequenciamento regular do vírus é crucial, dizem os pesquisadores.