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Recombinação aprimorada entre variantes de ômicron demonstrada contribui para a fuga imune viral, constata estudo

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Recombinação aprimorada: um tiro no braço para SARS-CoV-2

Distribuição temporal das sequências de VOCs do SARS-CoV-2, distribuição temporal percentual das sequências de linhagem recombinante do SARS-CoV-2 e um número diário de linhagens circulando: (A) Prevalência de variantes de preocupação do SARS-CoV-2 (VOC) com X- eixo mostrando a data da coleta da sequência, eixo Y mostrando várias sequências coletadas e depositadas em média móvel de 7 dias. Diferentes VOCs são representados em cores únicas. (B) Porcentagem de sequências pertencentes a cada linhagem recombinante com eixo X e eixo Y iguais aos da Figura 1A suplementar. Diferentes linhagens recombinantes são representadas em cores únicas que são as mesmas usadas para representar linhagens recombinantes na Figura 1A. (C) Curva de área mostrando o número de linhagens únicas prevalentes diariamente, com o eixo X representando a data de coleta da sequência da linhagem, o eixo Y representando o número de linhagens únicas circulando a cada dia e as cores representando o tipo de linhagem (recombinante — vermelho, todas as linhagens — cinza escuro. O eixo X de todos os três gráficos varia de 1º de dezembro de 2019 a 1º de julho de 2022 com marcas de eixo indicando meses e estão alinhados, tornando-os temporalmente comparáveis ​​entre si. Crédito: Jornal de Virologia Médica (2023). DOI: 10.1002/jmv.28519

Em janeiro de 2022, na época em que a variante ômicron do SARS-CoV-2 começou a se espalhar rapidamente, uma equipe de pesquisadores do Indian Institute of Science (IISc) liderada por Shashank Tripathi, professor assistente do Departamento de Microbiologia e Biologia Celular, e Centro de Pesquisa de Doenças Infecciosas, notaram que houve um aumento incomumente alto no número de cepas recombinantes da variante omicron.

A equipe analisou sequências genômicas de todos os que apareceu entre novembro de 2019 e julho de 2022 em vários bancos de dados em todo o mundo. Em um estudo publicado no Jornal de Virologia Médicaeles identificaram várias novas mutações que se acumularam por recombinação em alta taxa e afetaram especialmente diferentes partes (domínios) da proteína viral spike.

Esses domínios, como o Receptor Binding Domain (RBD) e o N Terminal Domain (NTD), são conhecidos por estarem envolvidos na ligação vírus-hospedeiro e também foram relatados como locais de ataque pelo sistema imunológico do hospedeiro. A equipe mostrou que, com a ajuda dessas mutações, várias dessas cepas recombinantes e mutantes de ômicron conseguiram escapar das defesas do hospedeiro e se ligar mais fortemente ao .

Suas observações aumentam a evidência crescente sobre a eficiência das novas cepas do vírus em escapar do ataque imunológico e causar infecções.

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Sabe-se que vírus como o SARS-CoV-2 mudam constantemente, tornando difícil para o nosso sistema imunológico identificá-los e destruí-los. Esta é uma grande preocupação ao gerar vacinas. O no SARS-CoV-2 é um longo RNA de cadeia simples. Além disso, sabe-se que a proteína necessária para fazer cópias desse RNA – RNA polimerase – é propensa a erros nesse vírus.

Os vírus podem evoluir por um de dois mecanismos: mutação ou recombinação, explica Tripathi. “Esta é uma estratégia para aumentar sua diversidade genética.” A polimerase não apenas permite que as mutações se acumulem, mas também causa a recombinação entre diferentes cepas do vírus. Isso é possível quando há coinfecção – quando uma célula hospedeira é infectada por mais de uma cepa do vírus.

“Ao copiar o RNA viral, a polimerase pode pular de um modelo de RNA para outro que esteja próximo”, diz Tripathi. Se a sequência próxima for de outra linhagem, a nova cópia será uma recombinante ou híbrida das duas linhagens parentais. Tripathi diz que atualmente existem mais de 35 recombinantes do SARS-CoV-2. Por exemplo, uma das variantes mais eficientes, a XBB, que surgiu em 2022, nasceu da recombinação entre duas outras versões do omicron, explica.

Existem duas razões possíveis para o aumento desses eventos de recombinação, de acordo com o estudo. Primeiro, o número de infecções e coinfecções foi alto durante a onda de 2022 omicron. Em segundo lugar, a equipe notou que uma mutação específica apareceu em um gene viral para uma exonuclease, uma proteína que pode clivar o RNA e acredita-se estar envolvida na recombinação. Tripathi explica: “Nossas descobertas mostram que o vírus não está esfriando, mas na verdade está aquecendo no que diz respeito às mutações”.

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Porque aprimorado podem aumentar as chances de surgimento de novas cepas, rastrear essas recombinações por meio do sequenciamento regular do vírus é crucial, dizem os pesquisadores.

Mais Informações:
Rishad Shiraz et al, Recombinação aprimorada entre subvariantes Omicron de SARS-CoV-2 contribui para a fuga imune viral, Jornal de Virologia Médica (2023). DOI: 10.1002/jmv.28519

Citação: A recombinação aprimorada entre as variantes de omicron demonstra contribuir para a fuga imune viral, encontra estudo (2023, 20 de março) recuperado em 20 de março de 2023 de https://medicalxpress.com/news/2023-03-recombination-omicron-variants-shown-contributes. html

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