Pesquisadores de microbioma desafiam o estado da arte na descoberta de biomarcadores de câncer de cólon

Pela primeira vez, investigadores da VIB-KU Leuven, UZ Leuven, Janssen Pharmaceutica e vários colaboradores internacionais introduziram métodos quantitativos e controlo extensivo de fatores de confusão para descobrir biomarcadores do microbioma no desenvolvimento do cancro colorretal. Embora vários táxons microbianos tenham sido apresentados como potenciais biomarcadores associados ao cancro no passado, este novo estudo revela contribuições obscuras que podem ter resultado em associações incorretas. Os resultados foram publicados em Medicina da Natureza.

A pesquisa do microbioma do câncer deu passos significativos na última década, levando a novos insights sobre biomarcadores associados ao câncer. Apesar dos numerosos avanços científicos, pesquisas anteriores concentraram-se em métodos descritivos e não quantitativos de descoberta de biomarcadores. A investigação liderada pelo Centro de Microbiologia VIB-KU Leuven, UZ Leuven e Janssen Pharmaceutica mostra agora os riscos de aderir a estes métodos. Em sua última publicação, eles levam em consideração os fatores de confusão do microbioma e a quantificação absoluta, com resultados surpreendentes.

Para este estudo pioneiro, os pesquisadores combinaram o perfil quantitativo do microbioma (QMP) com a fenotipagem extensa de pacientes de um grupo de 589 pacientes em vários estágios de câncer colorretal. Além disso, reanalisaram os dados de quinze estudos publicados abrangendo um total de 4.439 pacientes e controles.

O estudo revelou que, na ausência de controle de confundidores, os resultados são equivalentes aos declarados pelos autores das coortes publicadas. No entanto, quando o controle de fatores de confusão e métodos quantitativos absolutos são incorporados, revela-se que algumas associações de biomarcadores microbianos anteriormente reivindicadas são motivadas por outros fatores, e não pelo diagnóstico de câncer.

“Este estudo mostra que devemos separar o joio do trigo ao estudar biomarcadores associados ao câncer. Ao implementar o controle de confusão e o perfil quantitativo, fomos capazes de revelar potenciais associações enganosas entre marcadores microbianos e o desenvolvimento de câncer colorretal, por exemplo, impulsionado pela inflamação intestinal “, diz o professor Dr. Jeroen Raes, PI e vice-diretor do Centro de Microbiologia VIB-KU Leuven e do Instituto Rega, Faculdade de Medicina, KU Leuven.

O estudo identifica o tempo de trânsito, a calprotectina fecal e o IMC como covariáveis ​​​​microbianas primárias, superando a variância explicada pelos grupos tradicionais de diagnóstico de CCR. Surpreendentemente, alvos bem estabelecidos de microbioma-CRC, como Fusobacterium nucleatum, não conseguem associar-se significativamente com grupos de diagnóstico de CRC ao controlar essas covariáveis.

Em vez disso, o estudo sublinha as associações robustas de Anaerococcus vaginalis, Dialister pneumosintes, Parvimonas micra, Peptostreptococcus anaerobius, Porphyromonas asaccharolytica e Prevotella intermedia com CRC, destacando o seu potencial como futuros alvos de intervenção.

“Esta pesquisa ressalta a importância de metodologias rigorosas para desvendar associações complexas entre doenças e microbiomas. Muitos dos alvos descobertos foram praticamente ignorados até agora”, comenta Raul Yhossef Tito-Tadeo, primeiro autor e pós-doutorado no Raes Lab.

Sara Verbandt, gerente de pesquisa do Digestive Oncology Group, KU Leuven, acrescenta: “Nossos resultados mostram a importância da fenotipagem rigorosa dos pacientes. Coletar todos esses dados extras em um estudo é uma quantidade enorme de trabalho, mas vale o esforço”.

As implicações clínicas deste estudo são importantes. Há uma grande necessidade de diagnósticos rápidos e não invasivos do câncer de cólon. As actuais ferramentas de rastreio (por exemplo, baseadas na presença de sangue nas fezes) não são suficientemente específicas e requerem demasiadas colonoscopias desnecessárias, sobrecarregando desnecessariamente o sistema de saúde.

“Exames de fezes rápidos e específicos permitirão que um número muito maior de indivíduos seja examinado precocemente, evitando muitas mortes desnecessárias por câncer de cólon”, conclui a Professora Dra. Sabine Tejpar, Gastroenterologista da UZ Leuven, chefe do grupo de Oncologia Digestiva e professora do Faculdade de Medicina KU Leuven.