Estudo descobre que sistema de vigilância detectou infecção ligada a colírios meses antes do surto ser declarado

Um sistema de vigilância de doenças infecciosas criado por cientistas da Faculdade de Medicina da Universidade de Pittsburgh e implantado num hospital UPMC sinalizou com sucesso casos de uma infecção resistente a medicamentos transmitida por colírios meses antes de as autoridades nacionais de saúde pública anunciarem um surto.

As descobertas, publicadas hoje em O Jornal de Doenças Infecciosas, foram obtidos por meio de um programa hospitalar denominado Sistema de Detecção Aprimorado para Transmissão Associada à Assistência à Saúde (EDS-HAT). Eles demonstram o potencial desta tecnologia para detectar e impedir surtos em todo o país mais cedo.

“Nosso estudo realmente mostra a utilidade da vigilância do sequenciamento do genoma completo”, disse a autora sênior Daria Van Tyne, Ph.D., professora assistente na Divisão de Doenças Infecciosas da Pitt Medicine. “Se mais hospitais usassem o EDS-HAT ou uma tecnologia semelhante cada vez mais acessível, eles poderiam evitar surtos dentro de suas paredes com muito mais rapidez. E se vários hospitais compartilharem esses dados entre si e com as autoridades de saúde pública, então os surtos nacionais poderiam ser interrompidos em seus rastros.”

O sequenciamento completo do genoma permite que os cientistas vejam as “impressões digitais” únicas do DNA dos patógenos em uma amostra de um paciente com infecção. Quando o código genético de duas amostras diferentes de pacientes é muito próximo, significa que um paciente de alguma forma transmitiu a infecção ao outro ou ambos a contraíram da mesma fonte, indicando um surto.

A UPMC, um prestador de cuidados de saúde sem fins lucrativos com hospitais na Pensilvânia, Nova Iorque e Maryland, é o único sistema hospitalar dos EUA que Van Tyne tem conhecimento de utilizar a sequenciação completa do genoma desta forma.

Em 1º de fevereiro de 2023, os Centros de Controle e Prevenção de Doenças dos EUA emitiram um alerta sobre um surto de uma cepa da bactéria Pseudomonas aeruginosa resistente a medicamentos, associada ao uso de lágrimas artificiais. Foram encontradas dezenas de casos em 13 estados, com pelo menos uma morte e vários casos de perda permanente da visão. Em abril de 2023, o CDC divulgou o código genético da cepa do surto.

Nesse ponto, Alexander Sundermann, Dr.PH, autor principal do estudo e professor assistente na Divisão de Doenças Infecciosas da Pitt Medicine, comparou o código recém-lançado do CDC com os resultados de sequenciamento do genoma completo mantidos em arquivo pela vigilância da UPMC. Ele conseguiu um fósforo.

Em outubro de 2022, a UPMC detectou dois casos de infecção resistente a medicamentos por meio do EDS-HAT. Isto apontava para um surto, pelo que os prevencionistas de infeções hospitalares investigaram, mas não foi possível encontrar nada em comum entre os pacientes – não tinham interagido entre si, não tinham os mesmos médicos, não permaneciam nos mesmos quartos e não tinham relações comuns. foram utilizados equipamentos hospitalares. Embora o prontuário de um paciente incluísse o uso de lágrimas artificiais, o outro não mencionou isso. E nenhum alerta de saúde pública havia sido emitido ainda.

Quando o CDC compartilhou o código genético, era a peça que faltava a Sundermann e Van Tyne para resolver o mistério. Ambos os casos fizeram parte do recém-anunciado surto ligado às lágrimas artificiais.

Depois de confirmar que a UPMC tinha visto casos de P. aeruginosa meses antes do alerta nacional, Sundermann e Van Tyne levaram a sua investigação um passo adiante, obtendo todas as sequências disponíveis de P. aeruginosa que tinham sido agora partilhadas. Isto permitiu-lhes construir uma “árvore genealógica” e rastrear as origens da bactéria até amostras recolhidas em 2013 e 2018 na Índia e na Nigéria, mas não vistas em amostras dos EUA antes de 2022. As suas descobertas são consistentes com relatos de que os colírios provavelmente estavam contaminados em uma fábrica no exterior no final de 2021 ou início de 2022.

“Foi necessário que o CDC partilhasse dados sobre a estirpe do surto para finalmente podermos ligar os pontos e ver que os nossos pacientes faziam parte do surto nacional”, disse Sundermann. “Imagine quão mais rápido todos nós poderíamos ter tomado conhecimento deste surto se mais hospitais estivessem realizando vigilância de sequenciamento do genoma completo e alimentando seus resultados em um banco de dados público centralizado. Encontramos nosso primeiro caso logo depois que esses colírios contaminados provavelmente começaram a ser usados ​​no EUA – meses antes do alerta do CDC – mas sem outro caso, não tínhamos como saber que havia um surto.”

Autores adicionais nesta pesquisa são Vatsala Rangachar Srinivasa, MPH; Emma G. Mills, BS; Marissa P. Griffith, BS; Kady D. Waggle, BS; Ashley M. Aires, MBA; BS, Lora Pless, Ph.D.; Graham M. Snyder, MD, MS; e Lee H. Harrison, MD, todos da Pitt, UPMC ou ambos.