Sequenciamento do genoma pode conter surtos de infecção hospitalar

Distribuição das linhagens clonais entre as 5 espécies mais prevalentes. Linhagens com Doenças Infecciosas Clínicas (2022). DOI: 10.1093/cid/ciac726

A disseminação de bactérias resistentes a antibióticos em hospitais pode ser bastante reduzida graças à pesquisa da Universidade de Queensland e da Queensland Health.

Uma equipe incluindo o Dr. Patrick Harris e o Dr. Brian Forde do Centro de Pesquisa Clínica da UQ usou todo o sequenciamento genômico como uma ferramenta de vigilância para identificar, rastrear e interromper rapidamente os patógenos que causam infecções graves associadas à saúde (HAI).

O Dr. Harris disse que as HAIs eram comuns e associadas a piores resultados para os pacientes e excesso de custos relacionados à saúde.

“Mais de 9% das pessoas internadas em hospitais na Austrália irão adquirir uma HAI e o custo do tratamento coloca um fardo enorme em um sistema de saúde sobrecarregado”, disse o Dr. Harris.

“O impacto é exacerbado pelo aumento das taxas de resistência antimicrobiana.

“Se o bactérias resistentes causar doenças graves, como infecções da corrente sanguíneaas taxas de mortalidade podem chegar a 20%.”

O estudo de quatro anos comparou bactérias resistentes a antibióticos coletados de pacientes em hospitais de Queensland para identificar ligações genômicas e, por sua vez, transmissão de paciente para paciente.

“Tradicional infecção métodos de controle e diagnóstico não podem rastrear com precisão as bactérias que causam essas infecções ou detectar eventos de transmissão em hospitais”, disse o Dr. Harris.

“Mas os testes genômicos podem potencialmente prevenir centenas de infecções, economizando milhões de dólares em custos excessivos com cuidados de saúde e, finalmente, reduzindo o sofrimento e as mortes dos pacientes”.

A equipe de pesquisa sequenciou e comparou os genomas de mais de 3.000 bactérias diferentes para fornecer notificação precoce de agrupamento, uma assinatura importante da provável transmissão hospitalar.

Dr. Forde disse que a chave para o sucesso do projeto foi o uso contínuo da genômica como uma ferramenta de vigilância.

“Implantar o sequenciamento dessa maneira significava que poderíamos identificar, rastrear e interromper a transmissão desses bactérias em tempo real”, disse o Dr. Forde.

“Usando genômica com dados epidemiológicos disponíveis, também fomos capazes de discriminar entre hospital e transmissão comunitária e direcionar a resposta de controle de infecção onde ela é mais necessária.”

O projeto demonstrou que a aplicação rotineira de vigilância genômica em tempo real para HAIs é viável.

“Embora sejam difíceis de implementar, as estratégias de prevenção de infecções baseadas em genômica provavelmente se tornarão o novo padrão-ouro”, disse o Dr. Forde.

“Os custos consideráveis ​​associados à execução disso como um serviço seriam justificados pelo potencial de economia para o sistema de saúde e maior prevenção de HAIs em pacientes vulneráveis.”

A pesquisa foi publicada em Doenças Infecciosas Clínicas.