Estudo de expressão gênica revela novas associações moleculares com obesidade

Uma nova pesquisa do Departamento de Informática Biomédica (DBMI) da Faculdade de Medicina da Universidade do Colorado identificou 45 genes cuja expressão gênica está associada ao índice de massa corporal (IMC), muitos dos quais não haviam sido explorados anteriormente na pesquisa da obesidade, após a pesquisadores conduziram um estudo usando uma coorte multiétnica.

Seu estudo, “Associações de expressão genética com índice de massa corporal no estudo multiétnico da aterosclerose”, publicado no Jornal Internacional de Obesidade, aponta para potenciais novos biomarcadores para obesidade. A equipe conseguiu isso aproveitando os dados de uma coorte grande e diversificada que foi originalmente reunida em 2000.

“Até agora, poucos estudos genéticos de IMC foram conduzidos em coortes ancestralmente diversas”, explica a principal autora Luciana Vargas. “A novidade do nosso estudo é o uso de medidas diretamente expressão genetica dados.”

Vargas, um Ph.D. da Faculdade de Medicina da UC. estudante com interesse em medicina personalizada, diz que essas associações genéticas conhecidas e novas podem fornecer informações sobre a biologia da obesidade, potenciais biomarcadores e alvos terapêuticos.

Para seu estudo, os pesquisadores dos laboratórios DBMI de Ethan Lange, Ph.D., e Leslie Lange, Ph.D., aproveitaram os dados do Estudo Multiétnico da Aterosclerose (MESA). Quando foi lançado, o MESA inscreveu mais de 6.000 pessoas, recrutadas em seis centros de campo em todo o país, para pesquisar fatores de risco e as características iniciais da doença cardiovascular. Os participantes continuam a se reportar aos centros de campo periodicamente para coleta de dados de saúde.

Devido à grande população de estudo etnicamente diversa e à quantidade de informações de saúde coletadas, os pesquisadores usaram seus dados para uma infinidade de estudos. O consórcio Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed), lançado em 2014, começou a reunir a expressão gênica e outros dados ômicos em um subconjunto de participantes do MESA, bem como participantes de muitas outras coortes.

“Usamos a coorte MESA porque é realmente difícil encontrar uma coorte bem definida com muitas medidas clínicas boas, obter o financiamento e manter o contato com os participantes do estudo para coletar sangue e fazer esses estudos ao longo do tempo”, diz Iain Konigsberg , Ph.D., instrutor de pesquisa em informática biomédica que trabalha com Vargas no DBMI Lange Lab.

Os pesquisadores analisaram dados de sequenciamento de RNA de quatro raças autoidentificadas e grupos étnicos na coorte MESA – afro-americanos, sino-americanos, hispânicos e brancos – para avaliar a associação da expressão de cada gene para um efeito no IMC. Muitas das características relacionadas ao risco cardiovascular também são relevantes para a obesidade, tornando o MESA coorte ideal para pesquisas sobre obesidade.

Os 45 genes que eles identificaram tinham expressões associadas ao IMC em todos os quatro grupos. Enquanto um pequeno número destes genes foram identificados por meio de estudos de associação genética, os autores da CU relataram muitas novas associações.

Konigsberg diz que seu trabalho aponta para a necessidade de mais diversidade na pesquisa sobre obesidade e espera que os resultados deste estudo informem estudos posteriores adicionais. Ele espera continuar a pesquisa usando MESA e coortes humanas adicionais. Tem sido uma lição valiosa em pesquisa colaborativa para Vargas, que começou seus estudos na CU Anschutz no outono de 2021 como Ph.D. Aluno do Programa de Genética e Genômica Médica Humana. Este é seu primeiro trabalho como estudante de pós-graduação e membro do Leslie Lange Lab.

“Envolver-se com o consórcio TOPMed, que inscreveu milhares de pessoas nos Estados Unidos, abriu novas oportunidades de pesquisa”, diz ela. “Eu realmente aprecio o poder da colaboração.”