Técnica transcriptômica pode ajudar a identificar infecções após artroplastia de joelho e quadril
indicam frações com valores de p ≤0,05 ao comparar casos PJIF com casos NIAF. Fig. C PCA mostrando agrupamento diferencial de casos PJIF e NIAF com base nas dimensões Dim1 e Dim2. Pontos quadrados de cores correspondentes indicam as médias geométricas da população amostral. figos. Curvas D e E ROC, incluindo as AUCs, para frações celulares previstas com a melhor capacidade de identificar amostras de casos de PJIF (Fig. D) e casos de NIAF (Fig. E). A significância foi determinada pelo teste t de Welch para 2 amostras. Os dados apresentados são de 40 casos NIAF e 53 casos PJIF. Crédito: The Journal of Bone & Joint Surgery (2022). DOI: 10.2106/JBJS.22.00605 Previsão de celularidade CIBERSORTx a partir do fluido sonicado, comparando indivíduos no grupo PJIF e no grupo NIAF. NK = natural killer, DC = célula dendrítica e Tfhs = células auxiliares foliculares T. Fig. A Análise geral da proporção relativa prevista (%) de cada uma das 22 frações celulares, mostradas como amostras individuais (esquerda) e médias (direita). Fig. B Diferença na proporção celular prevista entre as amostras dos casos PJIF e NIAF. Asteriscos indicam frações com valores de p ≤0,05 ao comparar casos PJIF com casos NIAF. Fig. C PCA mostrando agrupamento diferencial de casos PJIF e NIAF com base nas dimensões Dim1 e Dim2. Pontos quadrados de cores correspondentes indicam as médias geométricas da população amostral. figos. Curvas D e E ROC, incluindo as AUCs, para frações celulares previstas com a melhor capacidade de identificar amostras de casos de PJIF (Fig. D) e casos de NIAF (Fig. E). A significância foi determinada pelo teste t de Welch para 2 amostras. Os dados apresentados são de 40 casos NIAF e 53 casos PJIF. Crédito:
O Jornal de Cirurgia de Ossos e Articulações (2022). DOI: 10.2106/JBJS.22.00605A infecção da articulação periprotética (IAP) é uma complicação devastadora da cirurgia de substituição do joelho e do quadril que pode, em alguns casos, ser difícil de distinguir de outras causas de falha da artroplastia. Uma ferramenta baseada em “ômica” que mede a abundância prevista de células imunes pode ajudar no diagnóstico de artroplastia malsucedida devido a IAP, sugere um estudo em
O Jornal de Cirurgia de Ossos e Articulações
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Uma “ferramenta de deconvolução celular baseada em transcriptômica” chamada CIBERSORTx – que permite a avaliação das respostas imunológicas subjacentes em casos de falha de artroplastia de joelho e quadril – pode distinguir IAP de causas não infecciosas de complicações após cirurgia de artroplastia, de acordo com a nova pesquisa de Robin Patel, MD, seu Ph.D. estudante Cody R. Fisher, e colegas da Mayo Clinic, Rochester, Minn.
As amostras de PJI mostram aumentos nas células imunes envolvidas na resposta à infecção
Embora se saiba que os neutrófilos estão elevados em locais de artroplastias infectadas, a medição das quantidades de neutrófilos normalmente envolve contagem de células ou visualização microscópica e não é possível em certos tipos de amostra. A transcriptômica é uma técnica emergente que usa sequenciamento de RNA para determinar quais genes são expressos.
O CIBERSORTx é uma ferramenta de análise para dados transcriptômicos que gera “perfis de celularidade previstos” a partir de dados de sequência de RNA em amostras com populações de células mistas. Ele fornece uma alternativa potencial aos métodos padrão de avaliação da composição da população celular de tipos de amostra inadequados e pode permitir que os métodos padrão sejam completamente abandonados.
O teste foi realizado em amostras de fluidos sonicados, obtidas por meio de uma técnica de ultrassom refinada pela Dra. Patel e sua equipe, que coleta amostras de superfícies de implantes removidos cirurgicamente. De acordo com o Dr. Patel, “o fluido Sonicate fornece uma interrogação direta das superfícies do implante e, portanto, fornece um tipo de amostra ideal para a investigação das principais respostas imunes durante a falha da artroplastia”. Os pesquisadores usaram o CIBERSORTx para comparar amostras de fluido sonicado de componentes de artroplastia de joelho e quadril com falha de 53 pacientes com IAP e 40 com causas não infecciosas de falha de artroplastia. Os perfis de celularidade previstos foram comparados para determinar se a abundância relativa de tipos de células específicos previstos diferia entre amostras infectadas e não infectadas – ajudando assim a fazer a distinção às vezes difícil entre os dois.Das 22 frações celulares previstas avaliadas, 12 mostraram diferenças na abundância relativa em amostras de IAP versus aquelas com falha de artroplastia não infecciosa. Não é de surpreender que as amostras de pacientes com IAP tenham proporções aumentadas de tipos de células imunes que desempenham “papéis cruciais na resposta imune a
infecção bacteriana “, de acordo com os autores. Dois tipos de células imunológicas previstas – neutrófilos e mastócitos ativados – foram “altamente capazes de diferenciar PJI” de falha de artroplastia não infecciosa. Em contraste, os casos de falha de artroplastia não infecciosa foram associados a células previstas envolvidas na “homeostase tecidual e reparo em resposta à inflamação crônica”. Por exemplo, isso incluiria inflamação causada por osteoartrite, artrite reumatóide ou reações imunes ao próprio dispositivo protético. Em particular, macrófagos/monócitos previstos, principalmente aqueles de fenótipos semelhantes a M0 e M1, foram associados a infecções não infecciosas
artroplastia
falha. As técnicas ‘Omics’ podem ajudar a enfrentar os desafios do diagnóstico de PJI Nos casos de PJI, alguns tipos de
células imunes
foram diferencialmente abundantes em infecções por Staphylococcus aureus versus S. epidermidis – as duas causas bacterianas mais comuns de IAP.
O Dr. Patel e os coautores reconhecem algumas limitações de seu estudo exploratório, incluindo o número relativamente pequeno de pacientes, resultando na incapacidade de realizar comparações entre alguns subgrupos de pacientes. Os pesquisadores concluem que “é necessária uma investigação adicional em coortes maiores e mais robustas para confirmar essas descobertas e estabelecer valores de corte potenciais para futuros testes de diagnóstico”. Mais Informações: Cody R. Fisher et al, Sonicate Fluid Cellularity Predicted by Transcriptomic Deconvolution Differentia Infectious from Non-Infectious Arthroplasty Failure, O Jornal de Cirurgia de Ossos e Articulações
(2022). DOI: 10.2106/JBJS.22.00605
CIBERSORTx:
cibersortx.stanford.edu/
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Citação
: A técnica transcriptômica pode ajudar a identificar infecções após a substituição do joelho e quadril (2022, 5 de dezembro) recuperado em 5 de dezembro de 2022 em https://medicalxpress.com/news/2022-12-transcriptomic-technique-infections-knee-hip.html Este documento está sujeito a direitos autorais. Além de qualquer negociação justa para fins de estudo ou pesquisa privada, nenhuma parte pode ser reproduzida sem a permissão por escrito. O conteúdo é fornecido apenas para fins informativos.
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